La VRII es la encargada de proponer las políticas generales, objetivos y metas en materia de investigación, innovación, transferencia tecnológica y creación artística, así como el seguimiento y las acciones que de ello se deriven, contribuyendo a garantizar la calidad de los procesos y el logro de los objetivos contenidos en el plan de desarrollo estratégico institucional.
Sobre la base de estos propósitos, la nueva institucionalidad incorporó dos unidades orgánicas: la Dirección de Investigación (DIUV) y la Dirección de Innovación y Transferencia Tecnológica (DITEC), que de forma coordinada organizan los distintos procesos y actividades que la Vicerrectoría lleva a cabo.